20 июня 2007 года прокуратура Новгородской области возбудила дело в отношении заместителя губернатора Николая Иванькова по двум статьям Уголовного кодекса РФ — "Злоупотребление должностными полномочиями" и "Мошенничество". По версии следствия, господин Иваньков незаконно получал путевки на отдых, а также ездил в отпуск в Сочи на служебном автомобиле. 15 июля чиновник ушел в отставку, в сентябре суд приговорил его к трем годам условно.
6 июля 2007 года областная прокуратура возбудила дело в отношении мэра Великого Новгорода Николая Гражданкина по статьям "Злоупотребление должностными полномочиями" и "Превышение должностных полномочий". Его обвинили в незаконном выделении 25,2 млн руб. из бюджета на ликвидацию чрезвычайной ситуации, которой в городе не наблюдалось, а также в выделении 15,6 млн руб. на приобретение 60 квартир (в 2008 году приговорен к штрафу 280 тыс. руб.). После этого в город с проверкой прибыла комиссия Генпрокуратуры. В том же месяце было возбуждено дело в отношении руководства госпредприятия "Новжилкоммунсервис" (отвечает за состояние ЖКХ области). Главу предприятия Евгения Шумилова и его зама Виктора Борзенкова обвинили в преднамеренном банкротстве и лжепредпринимательстве (в 2012 году приговорены к одному году и двум месяцам лишения свободы каждый).
3 августа 2007 года президент Владимир Путин удовлетворил прошение новгородского губернатора Михаила Прусака о досрочной отставке. Решение господин Прусак принял после встречи с полпредом президента Ильей Клебановым, который называл ситуацию в области "острокриминальной".
В ноябре 2007 года заочные обвинения были предъявлены двум "крестным отцам" региона — "авторитетным" предпринимателям Николаю Кравченко (Коля Бес) и Тельману Мхитаряну. Последний ранее был советником Михаила Прусака по политическим вопросам и почетным гражданином Великого Новгорода. Николая Кравченко обвинили в организации убийства, а Тельмана Мхитаряна — в вымогательстве крупной суммы у конкурента по бизнесу. Оба были заочно арестованы и объявлены в розыск. В 2010 году господин Мхитарян был задержан в Армении и экстрадирован в Россию, его дело слушается в суде. Господин Кравченко задержан и арестован на Украине в марте 2013 года.