В ноябре 1997 года Индия заказала у России три фрегата типа Talwar (проект 1135.6). Балтзавод в Петербурге должен был сдать корабли в мае 2002 — мае 2003 года, однако сроки были сдвинуты из-за неудачных стрельб зенитно-ракетного комплекса "Штиль-1" во время приемо-передаточных испытаний. Корабли были переданы в июне 2003 — апреле 2004 года после доработки комплекса и дополнительных испытаний. Сроки поставки еще трех фрегатов Talwar, заказ на которые в 2006 году получил калининградский завод "Янтарь", также были отодвинуты на год. Минобороны Индии называло в качестве причины недостаток квалифицированной рабочей силы и проблемы с поставками комплектующих от субподрядчиков. Контракт был завершен в апреле 2012 — июне 2013 года.
В январе 2004 года РФ и Индия договорились о переоборудовании и передаче ВМС Индии авианосца "Адмирал Горшков" (индийское название Vikramaditya). Сдать крейсер планировалось к 2008 году, однако этот срок неоднократно переносился, а сумма контракта выросла с $974 млн до $2,33 млрд. В 2012 году во время ходовых испытаний в Баренцевом море вышли из строя семь из восьми паровых котлов авианосца. В результате срок передачи перенесен на осень 2013 года.
В январе 2004 года Россия заключила с Индией контракт на достройку и передачу в лизинг атомной подводной лодки К-152 "Нерпа" (Chakra). Предполагалось, что передача состоится в 2007 году, но сроки перенесли. В ноябре 2008 года во время сдаточных испытаний произошло несанкционированное срабатывание системы пожаротушения, в результате чего погибли 20 человек. После устранения неполадок индийцы получили АПЛ в январе 2012 года.
В июне 2005 года завод "Звездочка" в Северодвинске принял на ремонт и модернизацию дизельную подлодку Sindhuvijay (проект 877ЭКМ), проданную индийцам в 1991 году. В январе 2008 года Индия отказалась принимать работу из-за недовольства новым противокорабельным ракетным комплексом Club-S, который в ходе испытаний не смог найти цели в шести последовательных запусках. Лодка была сдана в августе 2008 года после устранения неполадок и дополнительных испытаний.