14 марта 2005 года уставный суд (УС) Санкт-Петербурга признал незаконной процедуру создания в структуре управления городом органа под названием "администрация губернатора". Спустя шесть дней губернатор Матвиенко заявила, что "давить на нее бесполезно" и администрация не будет ликвидирована.
В ответ 22 марта уставный суд принял решение о продлении полномочий судей УС "на неограниченный срок". 20 мая УС опубликовал официальное разъяснение своего постановления от 14 марта. В этом разъяснении указывалось, что правительство Санкт-Петербурга обязано отменить все правовые акты, принятые "несуществующим органом власти" (администрацией губернатора.— Ъ). Суд также аннулировал полномочия администрации и ее руководителя Виктора Лобко, "правой руки" губернатора.
25 мая законодательное собрание (ЗС) Санкт-Петербурга изменило закон об УС, а через неделю и устав города. Поправки предусматривали сокращение полномочий судей УС и их переизбрание к 14 сентября 2005 года. Депутаты также запретили УС устанавливать свой регламент. В результате 14 июня УС приостановил свою деятельность.
15 июня группа жителей Петербурга оспорили решения ЗС в городском суде. Суд отложил рассмотрение дела, направив в Конституционный суд РФ запрос о конституционности федеральной правовой базы о судебной системе и статусе судей.
7 июля депутаты ЗС приняли новый регламент и процедуру назначения судей УС. 14 июля запланированное заседание УС "по новым правилам" не состоялось из-за отсутствия кворума — не пришли сторонники губернатора.
29 июля Валентина Матвиенко обратилась в ЗС с предложением прекратить полномочия пяти из семи судей УС. 1 августа трое судей УС написали заявления об отставке.
1 и 2 августа судья УС Людмила Кулешова направила в Конституционный суд жалобы о том, что поправки в устав и закон об УС противоречат Конституции РФ. 23 августа губернатор направила в ЗС новое представление — о прекращении полномочий шести судей УС (за исключением Людмилы Кулешовой).