Межрегиональная общественная организация (МОО) "Открытая Россия" создана в декабре 2001 года группой физических лиц, в основном акционеров НК ЮКОС. Среди учредителей — Ирина Ясина, Владимир Дубов, Илья Ломакин-Румянцев, Василий Шахновский. Председателем правления МОО стал Михаил Ходорковский. "Открытая Россия" представляет собой аналог частного фонда: учредители и другие граждане из личных средств перечисляют пожертвования, а организация использует полученные средства на цели, записанные в уставе,— просветительскую и благотворительную деятельность. Конкретные мероприятия проводят другие организации, в адрес которых на основе договора жертвования перечисляются необходимые деньги. В первое время МОО финансировалась из прибыли МЕНАТЕПа, а с февраля 2004 года основным источником ее финансирования являются личные пожертвования Михаила Ходорковского. В 2002 году "Открытая Россия" взяла под патронаж созданную в апреле 2000 года Федерацию интернет-образования, которая специализируется на обеспечении учебных заведений в регионах России высококачественной техникой. В 2002 году МОО стала генеральным спонсором литературной премии "Русский Букер", но с 2006 года отказалась от ее финансирования. Под эгидой "Открытой России" работает Институт прикладных международных исследований, Институт внешней и оборонной политики, клуб региональной журналистики "Из первых уст". В 2002 году "Открытая Россия" совместно с Академией российского телевидения, Национальной ассоциацией телерадиовещателей и "Медиасоюзом" провела первый всероссийский телеконкурс "ТЭФИ-Регион". Расходы "Открытой России" на реализацию программ по поддержке просвещения, культуры, гражданских инициатив и благотворительности в 2003 году составили около 360 млн руб.