27 ноября 1995 года Игорь Трунов приговорен Хорошевском судом Москвы к шести годам лишения свободы за мошенничество с приобретением квартир. Затем Мосгорсуд направил дело на новое рассмотрение, и в октябре 1998 года уголовный процесс был прекращен в связи с отсутствием состава преступления. Сам господин Трунов провел несколько лет в СИЗО и в 2004 году безуспешно пытался взыскать с Минфина компенсацию за свое незаконное содержание под стражей. После освобождения судился и со СМИ — в частности, 20 апреля 1999 года Головинский суд Москвы обязал Ъ опровергнуть материал о причастности господина Трунова к гибели продавца одной из купленных им квартир (данный эпизод не был доказан следствием).
С ноября 2002 года представлял потерпевших в результате захвата театрального центра на Дубровке. Представлял 86 истцов, требовавших от правительства Москвы компенсации ущерба. Тверской суд Москвы признал претензии 41 истца, присудив им единовременные выплаты от 2,7 тыс. до 75,4 тыс. руб.
13 марта 2003 года подал иск о защите чести к "Первому каналу" и ведущему Михаилу Леонтьеву, обвинившему его в ведении дел по "Норд-Осту" ради "бесплатной раскрутки". Иск с требованием 320 тыс. руб. компенсации отклонен.
С 2003 года представлял пострадавших при взрывах домов в Москве и Волгодонске в 1999 году. 13 января 2004 года Мосгорсуд постановил взыскать с двух террористов в пользу пострадавших 4,8 млн руб. В 2004 году отсудил для двух истиц 289 тыс. руб. и пенсии от правительства Москвы, в мае 2006 года — еще 1,8 млн руб. от террористов.
С февраля 2004 года защищал пострадавших от обрушения "Трансвааль-парка". Удовлетворены три иска к ЗАО "Европейские технологии и сервис" на суммы от 70 тыс. до 1,3 млн руб. Безуспешно пытался обжаловать амнистирование архитектора Нодара Канчели, признанного виновным в трагедии.
С марта 2005 года представляет матерей погибших в Кармадонском ущелье режиссера Сергея Бодрова и актера Тимофея Носика. После отклонения иска на $900 тыс. к правительствам РФ и Северной Осетии направил жалобу в Евросуд.
С октября 2006 года является адвокатом родственников погибших в авиакатастрофах самолетов A310 в Иркутске и Ту-154 под Донецком. Двое клиентов требуют 20 млн руб. с авиакомпании S7 и еще 17 млн руб. с Airbus, еще трое — 36 млн руб. с авиакомпании "Пулково".