25 октября 2012 года сотрудники СКР и МВД в рамках возбужденных дел о мошенничестве провели обыски в подконтрольном Минобороны холдинге «Оборонсервис» (в январе 2015 года переименован в ОАО «Гарнизон») и связанных с ним компаниях. Выемки документов прошли также в квартире экс-главы департамента имущественных отношений министерства Евгении Васильевой — соседки по дому главы военного ведомства Анатолия Сердюкова. Ущерб от продажи имущества Минобороны по заниженной стоимости оценивался в 3 млрд руб.

1 ноября Хамовнический райсуд Москвы арестовал Екатерину Сметанову, возглавлявшую центр правовой поддержки «Эксперт» (агент ОАО «Оборонсервис» по продаже активов), а также ее гражданского мужа Максима Закутайло (позднее оба были освобождены под подписку о невыезде). Евгения Васильева была вскоре заключена под домашний арест. Фигурантами дела также стали еще несколько руководителей структур «Оборонсервиса» и коммерческих организаций.

6 ноября президент Владимир Путин отправил Анатолия Сердюкова в отставку, «чтобы создать условия для объективного расследования». К концу месяца ущерб от хищений СКР оценивал уже в 6,7 млрд руб. Дальнейшее расследование дела «Оборонсервиса» выявило около 30 эпизодов хищения военной недвижимости, земель и акций крупных предприятий. Евгения Васильева обвинялась в организации 12 махинаций при продаже объектов Минобороны. Анатолий Сердюков проходил по делу как свидетель.

Начиная с марта 2013 года новые владельцы стали возвращать имущество Министерству обороны. Так, по решению суда участок побережья на Васильевском острове в Петербурге передан Росимуществу. Тогда же, в марте, Минобороны получило обратно в дар 100% акций ОАО «31-й ГПИСС», а в августе Арбитражный суд Краснодарского края принял к рассмотрению проект мирового соглашения, по которому Минобороны вернуло себе участок, известный как «дача Сердюкова».

28 ноября 2013 года Анатолий Сердюков стал подозреваемым по делу о незаконном благоустройстве базы отдыха «Житное». 3 декабря он был допрошен и освобожден под подписку о невыезде, а 6 декабря экс-министру было предъявлено обвинение по ч. 1 ст. 293 УК РФ («Халатность»). Однако в 2014 году его уголовное преследование было прекращено в связи с амнистией, принятой к 20-летию Конституции.

10 июля 2014 года в Пресненском суде Москвы началось рассмотрение по существу дела Евгении Васильевой и четверых ее сообщников — бывших руководителей дочерних структур «Оборонсервиса» Максима Закутайло, Ларисы Егориной, Юрия Грехнева и Ирины Егоровой. Ранее, с апреля 2013 года по апрель 2014 года, на реальные сроки от двух до пяти лет были осуждены восемь фигурантов дел, связанных с делом «Оборонсервиса», в том числе экс-директор ООО МИРА Динара Билялова, получившая, по версии следствия, незаконные комиссионные в размере 113 млн руб. за продажу военной недвижимости.

23 апреля 2015 года в ходе прений прокуратура попросила приговорить Евгению Васильеву и еще четверых фигурантов дела к условным срокам — от четырех до восьми лет лишения свободы. Ранее в том же месяце структуры Минобороны отказались от денежных претензий к Евгении Васильевой в размере 2,2 млрд руб.