27 февраля 2015 года около 23:00 в Москве на Большом Москворецком мосту был застрелен сопредседатель партии РПР—ПАРНАС и депутат Ярославской облдумы Борис Немцов. По словам свидетельницы Анны Дурицкой, сопровождавшей политика, киллер расстрелял господина Немцова со спины, после чего сел на пассажирское сиденье белой машины и уехал. 28 февраля президент Владимир Путин поручил Следственному комитету, ФСБ и МВД создать единую следственную группу и взял расследование под личный контроль.

7 марта в Ингушетии были задержаны подозреваемые в убийстве — офицер батальона «Север» полка внутренних войск МВД Заур Дадаев и его троюродные безработные братья Анзор и Шадид Губашевы. 8 марта в Одинцовском районе Подмосковья были задержаны еще двое подозреваемых — безработные Хамзат Бахаев и Темирлан Эскерханов. Тогда же в Чечне при задержании подорвался на гранате бывший боец «Севера» Беслан Шаванов. Басманный суд Москвы арестовал всех задержанных до 28 апреля и предъявил обвинение Анзору Губашеву и Зауру Дадаеву в убийстве по найму и незаконном обороте оружия. Вину в причастности к убийству признал только последний. По его словам, решение об убийстве Немцова было принято из-за его высказываний в поддержку карикатур на пророка Мухаммеда во французском журнале Charlie Hebdo. Также стало известно, что 23 декабря 2014 года Дадаев написал рапорт об увольнении с воинской службы по собственному желанию, он был уволен 28 февраля 2015 года.

8 марта же глава Чечни Рамзан Кадыров в своем Instagram назвал Дадаева «настоящим патриотом России», подчеркнув, что тот он «не мог сделать и шага против России, ради которой многие годы рисковал собственной жизнью».

16 марта были предъявлены обвинения трем оставшимся арестованным. Все, кроме Дадаева, обвинялись в пособничестве. Обвиняемые неоднократно обжаловали свой арест, но он неизменно продлевался, последний раз — 19 февраля 2016 года, до 7 марта. Срок предварительного расследования продлен до 28 февраля 2016 года.

“Ъ” 16 марта сообщил, ссылаясь на анонимный источник, что Заур Дадаев переехал в Москву в сентябре 2014 года вместе с бывшим заместителем командира батальона «Север» Русланом Геремеевым. По данным “Ъ”, он допрашивался в марте в Грозном в качестве свидетеля, но никаких официальных комментариев в отношении военного от следственных органов не высказывалось.

1 апреля Заур Дадаев отказался от признания в убийстве, заявив о наличии алиби и добавив, что «показания были даны под давлением и под диктовку», уточнив, что он был похищен в Магасе 5 марта, подвергался пыткам, а 7 марта привезен в Москву. Позже СК отказался возбудить дело о пытках.

В номере “Ъ” от 1 июля были опубликованы подробности признательных показаний Анзора Губашева, данные им 18 марта 2015 года в СИЗО «Лефортово». По его словам, он, Шаванов и Дадаев готовили убийство с января. 27 февраля Шаванов и Анзор Губашев следили за офисом и домом Бориса Немцова, позже они забрали на автомобиле Дадаева после убийства. 28 февраля Шаванов и Губашев улетели домой.

9 ноября в организации убийства был заочно обвинен и объявлен в розыск офицер батальона «Север» Руслан Мухудинов. 18 ноября он был заочно арестован Басманным судом. По данным следствия, он мог нелегально покинуть территорию РФ под чужим паспортом. Предположительно, находится в ОАЭ. В том же месяце было прекращено уголовное преследование Беслана Шаванова ввиду его смерти.

25 декабря следователь в Басманном суде заявил, что убийство Бориса Немцова не связано с «его политической и государственной деятельностью». Тогда же адвокат семьи политика Вадим Прохоров сообщил, что преступление не связано с высказываниями политика о Charlie Hebdo, поскольку «новое обвинение говорит, что убийство готовилось с сентября, а карикатуры опубликовали в январе».

29 декабря следствие предъявило фигурантам дела обвинение в окончательной редакции. По словам адвоката Дадаева Шамсудина Цакаева, подзащитный своей вины не признал. Заказчиком и организатором был назван Руслан Мухудинов.

20 января 2016 года глава СК Александр Бастрыкин заявил, что убийство Бориса Немцова раскрыто. 29 января СК заявил об окончании расследовании дела.

26 февраля стало известно, что Руслан Геремеев намерен дать показания, но сделает это в форме письменного заявления. В нем он сообщит, где находился в момент убийства Бориса Немцова.