Судей Конституционного суда (КС) назначает Совет федерации, однако предложения по кадрам верхней палате вносит президент. Список формируется главой государства на основании предложений, которые могут вноситься членами Совета федерации, депутатами Государственной думы, «законодательными органами субъектов, высшими судебными органами, федеральными юридическими ведомствами, всероссийскими юридическими сообществами, юридическими научными и учебными заведениями», говорится в ст. 9 закона «О КС». При этом с 2014 года, согласно принятым поправкам, если в случае выбытия судьи из состава КС число судей окажется менее двух третей от общего числа, президент может без сбора предложений внести кандидатуру на утверждение в верхнюю палату. Отправить в отставку судью КС можно в случае «совершения им поступка, порочащего честь и достоинство судьи», совершения «действий, несовместимых с его должностью» даже после предупреждения со стороны суда, пропуска заседаний или отказа голосовать несколько раз подряд. Прекращаются полномочия и при достижении предельного возраста пребывания в должности судьи — 70 лет. Последнее ограничение с 2010 года снято для главы КС. Однако каждые шесть лет он должен проходить переназначение: кандидатуру Совету федерации предлагает президент.
Официального увольнения судей КС не было даже в то время, когда судьи позволяли по серьезным поводам не соглашаться с президентской властью. В сентябре 1993 года КС во главе с Валерием Зорькиным признал неконституционным указ №1400 Бориса Ельцина, которым тот приостановил деятельность Съезда народных депутатов и Верховного Совета до проведения выборов в Госдуму. В декабре 1993 года полномочия господина Зорькина как судьи КС были прекращены «за политическую деятельность», а восстановило их совещание КС 25 января 1994 года (на должность председателя КС он вернулся в 2003 году, во время президентства Владимира Путина). В 2009 году пленум КС рекомендовал досрочно сложить полномочия судье КС Владимиру Ярославцеву из-за несоблюдения судейской этики и закона «О статусе судей», предписывающих судьям «вне рамок профессиональной деятельности подвергать сомнению постановления судов, вступивших в законную силу». Господина Ярославцева коллеги осудили за интервью газете El Pais 31 августа того же года под заголовком «В России правят органы безопасности, как в советские времена». В нем он заявил, что «судебная власть в России за время президентства Владимира Путина и его преемника Дмитрия Медведева превратилась в инструмент на службе исполнительной власти». Сложил полномочия и судья Анатолий Кононов, в свою очередь, заявив в октябре того же года в интервью газете «Собеседник» под заголовком «Независимых судей в России нет», что «Ярославцева в лучших традициях "высекли" на нашем пленуме».
Зампред КС в отставке Тамара Морщакова объяснила “Ъ”, что судьи защищены Конституцией, она гарантирует их несменяемость. «Их нельзя менять, в том числе по политическим причинам, нельзя снять, например, в связи с утратой доверия, потому что нет органов и лиц, чье доверие они должны реализовывать, судьи подчиняются только Конституции и закону, вопрос об их удалении с должности решает само судейское сообщество»,— говорит госпожа Морщакова. При этом она отметила, что дисциплинарная ответственность, к которой может быть привлечен судья, «имеет крайне размытые основания, под которые можно подвести все что угодно».