21 апреля 1996 года у чеченского села Гехи-Чу уничтожен первый президент Чеченской республики Ичкерия Джохар Дудаев. По общепринятой версии, российские спецслужбы запеленговали разговор, который он вел по спутниковому телефону, и бомбардировщик Су-24 выпустил по обнаруженной точке ракету.
После гибели Дудаева его пост занял вице-президент Ичкерии Зелимхан Яндарбиев, убитый при взрыве автомобиля 13 февраля 2004 года в столице Катара Дохе. 19 февраля за убийство господина Яндарбиева задержаны граждане РФ Анатолий Яблочков и Василий Пугачев, которых СМИ назвали сотрудниками ГРУ. 30 июня суд Дохи приговорил их к пожизненному заключению, в декабре 2004 года они переданы России для дальнейшего отбывания наказания.
27 января 1997 года новым президентом Ичкерии избран премьер-министр республики, бывший начальник главного штаба дудаевской армии Аслан Масхадов. Он взял на себя командование чеченскими отрядами во время второй войны и был уничтожен 8 марта 2005 года в селении Толстой-Юрт в ходе спецоперации ФСБ. По одной из версий, Масхадов приказал охраннику застрелить его после того, как их бункер был обнаружен.
В паре с Асланом Масхадовым вице-президентом был избран Ваха Арсанов. В 2001 году его уволили "за самоустранение от боевых действий". 15 мая 2005 года Ваха Арсанов убит в перестрелке с милицейским патрулем в Грозном.
Следующим вице-президентом у Аслана Масхадова был Абдул-Халим Сайдулаев, в 2005 году возглавивший "ичкерийское сопротивление". Его уничтожили 17 июня 2006 года на окраине Аргуна. По словам тогдашнего премьера Чечни Рамзана Кадырова, боевика выдал кто-то из его окружения всего за 1500 руб.
Меньше чем через месяц, 10 июля 2006 года, на окраине села Экажево Назрановского района Ингушетии в результате спецоперации ФСБ был взорван "КамАЗ", в котором находился один из главных лидеров незаконных вооруженных формирований — первый вице-премьер Ичкерии, бригадный генерал и террорист Шамиль Басаев.