2 ноября 1992 года был введен пост главы временной администрации в Северной Осетии и Ингушетии в ранге вице-премьера правительства России. За три года его занимали шесть человек. Самым известным из них был вице-премьер Виктор Поляничко, назначенный 26 июня 1993 года и убитый 1 августа того же года по пути на переговоры с ингушскими командирами.
С 1994 по 1999 год ответственными за ситуацию на Кавказе, в первую очередь в Чечне, официально считались вице-премьеры по национальной политике Сергей Шахрай, Николай Егоров, Вячеслав Михайлов и Рамазан Абдулатипов, однако реальных возможностей влиять на ситуацию они зачастую не имели.
15 октября 1999 года премьер Владимир Путин назначил замминистра путей сообщения Николая Кошмана полпредом правительства в Чечне в ранге вице-премьера. В июле 2000 года эту должность упразднили. 28 ноября 2000 года президент Владимир Путин ввел должность министра по координации деятельности федеральных органов исполнительной власти в Чечне, которую занял зампред Госстроя Владимир Елагин. 7 ноября 2002 года его сменил бывший премьер Чечни Станислав Ильясов. В итоге должность упразднили в ходе реформы правительства весной 2004 года.
В августе 2004 года по поручению Владимира Путина была создана межведомственная комиссия по восстановлению соцсферы и экономики Чечни во главе с министром экономического развития Германом Грефом. За три следующих года господин Греф провел несколько выездных заседаний комиссии в Грозном.