В марте 2009 года прокуратура Самарской области привлекла к административной ответственности и оштрафовала на 200 тыс. рублей главу областного минтранса
Валерия Матвеева за то, что ведомство заключило с АСАДО четыре госконтракта на сумму более 1 млрд рублей не на тендерной основе.
В июле ТПП Тольятти пожаловалось в областное УФАС на то, что минтранс формирует слишком крупные лоты и тем самым якобы ограничивает конкуренцию. Антимонопольщики не обнаружили нарушения законодательства.
В августе депутат Самарской области Александр Колычев создал рабочую группу по проверке деятельности минтранса по строительству и ремонту дорог. Господин Колычев заявил, что группа обнаружила множество нарушений. Среди них: увеличение затрат на строительство, ремонт и проектирование дорог от 15 до 50%, неоднократный ремонт одного и того же объекта, несоблюдение нормативов ремонта и т.д. Минтранс с претензиями не согласился.
В октябре счетная палата завершила проверку деятельности минтранса в части расходования бюджетных средств. Аудиторы насчитали 325 млн рублей, неэффективно использованных министерством.