В российской столице с начала 1990-х годов произошло полтора десятка терактов, связанных в общественном сознании с "кавказским следом". В них погибли 454 и были ранены 642 человека.
11 июня 1996 года самодельная бомба взорвалась в вагоне метро между станциями "Тульская" и "Нагатинская", четыре человека погибли, 12 получили ранения. Ответственность взял на себя чеченский террорист Салман Радуев.
11 июля 1996 года взрыв прогремел в троллейбусе маршрута N 12 на Пушкинской площади, пострадали шесть человек. На следующий день был взорван троллейбус маршрута N 48 на проспекте Мира, пострадали 28 человек. В организации обоих взрывов также признался Радуев.
31 августа 1999 года теракт произошел в торговом комплексе "Охотный ряд" на Манежной площади. Пострадали 40 человек, одна женщина скончалась. Вину за взрыв никто на себя не взял, однако в 2009 году за этот теракт на сроки 25 и 15 лет осуждены чеченец Халид Хугуев и дагестанец Магомадзаир Гаджиакаев (1 апреля 2010 года Верховный суд РФ смягчил наказание до 22 и 13 лет соответственно). Им также инкриминировали взрыв 26 апреля 1999 года в гостинице "Интурист", в результате которого пострадали 11 человек. По данным следствия, преступники действовали по приказу чеченского полевого командира Шамиля Басаева.
9 и 13 сентября 1999 года были взорваны дома на Каширском шоссе и улице Гурьянова. В первом случае погибли 109 и были ранены 164 человека, во втором — погибли 124 и пострадали 9 человек. Ответственность за взрывы брали на себя "Конфедерация освобождения Дагестана" и Шамиль Басаев. Двое исполнителей теракта — карачаевцы Адам Деккушев и Юсуф Крымшамхалов — в 2004 году получили пожизненные сроки.
8 августа 2000 года взрыв прогремел в подземном переходе на станции "Пушкинская". 13 человек погибли, 118 пострадали. Под подозрение попали ваххабиты и левые радикалы. Кроме того, рассматривалась версия криминальной разборки, однако вину за теракт так никто на себя и не взял.
19 октября 2002 года бомба сработала в автомобиле "Таврия", припаркованном у ресторана McDonald`s на юго-западе Москвы. В результате теракта один человек погиб, еще восемь получили ранения. Официально ответственность за теракт никто на себя не взял, однако организатором теракта были признаны Шамиль Басаев и чеченец Асланбек Хасханов. Последний в 2006 году был приговорен к 22 годам лишения свободы.
23 октября 2002 года банда Мовсара Бараева захватила театральный центр на Дубровке, где шел спектакль "Норд-Ост". При штурме здания все террористы были уничтожены, однако погибли 130 заложников. Ответственность за организацию захвата взял на себя Басаев.
5 июля 2003 года две смертницы подорвали себя на аэродроме в Тушино у входа на рок-фестиваль "Крылья". Погибли 16 человек, 59 были ранены. В организации теракта вновь признался Басаев.
9 июля 2003 года на 1-й Тверской-Ямской улице милиционеры задержали уроженку Чечни Зарему Мужихоеву. У женщины обнаружили взрывное устройство, которое она не смогла привести в действие. Во время разминирования бомбы погиб взрывотехник ФСБ Георгий Трофимов. В 2004 году террористка получила 20 лет лишения свободы.
9 декабря 2003 года смертница взорвала себя у гостиницы "Националь". Шесть человек, включая шахидку, погибли, еще 14 получили ранения. Вину за акцию взял на себя Басаев.
6 февраля 2004 года террорист-смертник привел в действие взрывное устройство в вагоне метро между станциями "Автозаводская" и "Павелецкая". Погиб 41 человек, 122 получили ранения. Ответственность за взрыв взяли на себя боевики так называемого карачаевского джамаата. Трое из них 2 февраля 2007 года получили пожизненные сроки.
31 августа 2004 года смертница подорвала себя возле станции метро "Рижская", погибли 8 человек, еще 51 получил ранения. Ответственность за теракт вскоре взяла на себя националистическая группировка "Бригады Исламбули", однако в 2007 году пожизненные сроки за этот теракт получили боевики карачаевского джамаата, обвинявшиеся также во взрыве на "Автозаводской".