Вопреки протестам граждан, Минкультуры и ЮНЕСКО, высота проектируемой башни "Охта-центра" с годами только растет.
В ноябре 2005 года ОАО "Газпром" заявило о намерении построить в Петербурге, в устье реки Охты, офисные здания для своих дочерних компаний. Высота комплекса, который глава монополии Алексей Миллер окрестил новой архитектурной доминантой Петербурга, должна была составить 300 м.
В декабре 2006 года победителем международного архитектурного конкурса на строительство "Охта-центра" стал проект английской компании RMJM, предложившей 396-метровую башню. Проект был самым высоким из участвовавших в тендере и в восемь раз превышал действовавший в этом районе высотный регламент, разрешавший застройку не выше 48 м.
В декабре 2007 года правительство Санкт-Петербурга изменило действовавший с апреля 2004 года высотный регламент, увеличив предельную высоту строительства на участке будущего центра с 48 до 100 м. Впрочем, авторы концепции сразу заявили, что проект можно понизить не более чем на 10%.
В августе 2009 года представители "Газпрома" воспользовались данной Градостроительным кодексом РФ возможностью отклонения от высотного регламента при наличии "неблагоприятных характеристик" земельного участка. В поданной заявке на строительство инвестор указал на "невозможность соблюдения требований комплексной безопасности при условии соблюдения градостроительных регламентов", а также на "ограниченную площадь застройки". Тогда же выяснилось, что высота здания вместе с цокольным этажом составит не 396, а 403 м.
В сентябре 2009 года положительное заключение на строительство 403-метрового небоскреба выдали комиссия по землепользованию и застройке Петербурга и городское правительство, а в октябре — губернатор Валентина Матвиенко. Последняя отметила, что "все юридические вопросы выдержаны строго в соответствии с законодательством". Между тем в октябре Росохранкультура выдала свое заключение об "Охта-центре", согласно которому на территории строительства находится охраняемый законом археологический памятник "Шведская крепость Ниеншанц", что запрещает возведение там зданий выше 40 м.