В феврале 2007 года спикер Госдумы и глава высшего совета партии "Единая Россия" Борис Грызлов в преддверии выборов в региональный парламент заявил о возможности замены Сергея Миронова в качестве сенатора от заксобрания Санкт-Петербурга. "Тех обид, которые нанесены действующим депутатам фракции "Единой России" в законодательном собрании Санкт-Петербурга, уже достаточно для того, чтобы наши представители не поддержали кандидатуру Миронова",— сказал он. Однако в марте депутаты нового созыва переутвердили господина Миронова сенатором.
В феврале 2010 года первые лица "Единой России" призвали Сергея Миронова подать в отставку после того, как спикер заявил, что не во всем поддерживает Владимира Путина. В частности, первый замсекретаря президиума партии Андрей Исаев оценил это заявление как "личный моральный крах" господина Миронова, а глава ЦИКа партии Андрей Воробьев назвал "логичным и целесообразным" его отзыв из Совета федерации. Глава думского комитета по конституционному законодательству единоросс Владимир Плигин даже обратился в Генпрокуратуру с просьбой инициировать проверку действий спикера при решении вопросов о выдвижении кандидатур в верхнюю палату парламента.
1 мая 2011 года глава регионального отделения партии "Единая Россия" и председатель заксобрания Санкт-Петербурга Вадим Тюльпанов заявил: "Нам надоело, что наш представитель просиживает штаны в Совете федерации, и большого толку его пребывания там мы не видим". 6 мая 2011 года Борис Грызлов подтвердил: "У партии есть позиция в отношении Миронова: он должен сдать мандат сенатора".