10 июня Михаил Ходорковский и Платон Лебедев были этапированы из московского СИЗО "Матросская Тишина" в места дальнейшего отбытия наказания. Отправка прошла втайне от родственников и адвокатов, хотя Уголовно-исполнительный кодекс обязывает ФСИН уведомлять родных о том, куда направляется осужденный. В среду информагентства со ссылкой на анонимные источники в силовых структурах передали, что Ходорковский находится в СИЗО Вологды, откуда будет отправлен на одну из карельских зон — предположительно в расположенную в Сегеже колонию общего режима N 7. Однако по состоянию на четверг ни адвокаты, ни родственники так и не смогли получить от пенитенциарного ведомства официальную информацию о местонахождении Ходорковского, сообщил "Власти" адвокат Вадим Клювгант. "Это прямое нарушение закона. Но прежде, чем что-то в этом отношении предпринимать, мы должны сначала его (Ходорковского.— "Власть") найти и убедиться, что с ним все в порядке",— добавил он. О Платоне Лебедеве источник "Интерфакса" сообщил в четверг, что его везут в Мурманскую область.
Точно так же развивались события в 2005 году после первого суда над бизнесменами. 10 октября их этапировали из Москвы, не сообщив родственникам и защите о пункте назначения. 13 октября в колонии особого режима ОГ 98/3, расположенной в поселке Харп Ямало-Ненецкого округа, был обнаружен Платон Лебедев: об этом сообщила окружная прокуратура. Родственников официально проинформировали лишь 19 октября. В этот же день СМИ сообщили, что Михаил Ходорковский находится в колонии общего режима ЯГ-14/10 города Краснокаменска Читинской области. 20 октября это официально подтвердила ФСИН, а жена Ходорковского Инна получила из СИЗО "Матросская Тишина" уведомление о том, что он отправлен в Краснокаменск. Таким образом, этапирование бывших совладельцев ЮКОСа, которые де-юре являются обычными зэками, осужденными не на самые длительные сроки по не самым общественно опасным статьям, вновь приняло вид масштабной тайной силовой спецоперации. Это говорит о том, что даже по поводу их перемещений по стране в тюремных вагонах у властей существует особая генеральная линия.