1 декабря 2005 года Лефортовский суд Москвы приговорил первого вице-президента ООО "ЮКОС-Москва" Михаила Трушина к 11 годам строгого режима заочно и штрафу в 1 млн руб. Суд признал его организатором хищения и отмывания 342 млн руб., принадлежавших ЮКОСу и направленных, согласно документам, на оказание благотворительной помощи в регионы.
1 августа 2008 года Мосгорсуд заочно приговорил бывшего вице-президента ЮКОСа Леонида Невзлина к пожизненному заключению. Он признан виновным в организации пяти убийств, пяти покушений на убийство и разбойного нападения. Суд также постановил взыскать с него в пользу потерпевших 5,5 млн руб.
6 октября 2010 года Таганский суд Москвы вынес заочный приговор экономисту московского ООО Amalgama DVD Group Елене Выборновой — восемь лет колонии общего режима. Она признана виновной в присвоении 74 млн руб., принадлежавших ЮКОСу. Ранее по этому делу были осуждены экс-заместитель управделами ЮКОСа Алексей Курцин, президент Amalgama DVD Group Борис Теременко и экс-помощник депутата Госдумы Александр Гольдман.
18 июля 2011 года Басманный райсуд Москвы заочно приговорил к восьми годам колонии строгого режима экс-главу подконтрольной ЮКОСу фирмы "Фаргойл" гражданина Испании Антонио Вальдеса-Гарсию. Суд установил, что испанец вместе с руководителями дочерних компаний ЮКОСа участвовал в хищении у нефтедобывающих предприятий $13 млрд и легализации $8,5 млрд из них.