15 января 2003 года около аэропорта Северный под Грозным были убиты трое чеченцев, работавших на военных объектах. Вскоре по подозрению в совершении преступления были задержаны офицеры 46-й бригады внутренних войск МВД — старший лейтенант Евгений Худяков и лейтенант Сергей Аракчеев.
26 января 2004 года в Северо-Кавказском окружном военном суде начался процесс по делу. Обвиняемые утверждали, что находились в момент убийства в другом месте, а свидетели отказались от показаний, заявив, что дали их под давлением следствия. 29 июня 2004 года офицеров оправдали, так как присяжные не увидели "события преступления".
11 ноября 2004 года военная коллегия Верховного суда РФ отправила дело на новое рассмотрение. 6 октября 2005 года присяжные Северо-Кавказского окружного военного суда вновь вынесли оправдательный вердикт, признав факт убийства, но сочтя недоказанным участие в нем офицеров ВВ. 5 мая 2006 года Верховный суд снова отменил приговор.
16 января 2007 года начался третий процесс. Дело вела тройка профессиональных судей, так как в 2006 году Конституционный суд запретил рассмотрение присяжными дел о военных преступлениях в Чечне до формирования таких судов в самой республике. 27 декабря 2007 года суд признал военных виновными в "умышленном убийстве двух и более лиц", а Худякова — еще и в "превышении должностных полномочий". Аракчеев был приговорен к 15 годам, Худяков, не явившийся на заседание (оба находились под подпиской о невыезде),— к 17 годам лишения свободы. 28 августа 2008 года военная коллегия Верховного суда РФ отклонила жалобы подсудимых на приговор. В итоге Худяков был объявлен в розыск, а Аракчеев направлен в колонию в Рязанской области.
25 февраля 2009 года адвокатами была подана жалоба в Европейский суд по правам человека, решения по которой пока нет. Начиная с 2 июня 2009 года Сергей Аракчеев подал четыре жалобы в Конституционный суд, но ни одна не была принята. Адвокаты и общественные защитники бывшего военного провели активную кампанию в его поддержку: Аракчеев прошел неофициальную проверку на полиграфе, выпустил несколько обращений к президенту и премьеру, про него был снят документальный фильм "На мне крови нет".