Решение чисто научных задач "Фобос-грунта" сводилось к тому, чтобы изучить малое тело Солнечной системы, которое состоит из первородного вещества — основы формирования всех твердых планет на заре формирования Солнечной системы. Как образовались спутники планет, до сих пор не ясно, — не только спутники Марса, но и Луна, и спутники других планет. Изучение спутников Марса дало бы универсальную картину, как могла бы образовываться планетная семья. Кроме того, перед учеными сейчас стоит задача доставки вещества непосредственно с Марса — это один из важнейших этапов, предшествующих полету человека на Марс. Так что экспедиция по доставке грунта со спутника Марса явилась бы крайне важным технологическим шагом для реализации последующих проектов.