18 мая 2000 года Владимир Путин назначил лидера фракции СПС в Госдуме Сергея Кириенко своим полпредом в Приволжском федеральном округе. 15 ноября 2005 года господин Кириенко возглавил Федеральное агентство по атомной энергии России (с 2007 года — госкорпорация "Росатом").
11 февраля 2004 года господин Путин предложил кандидатуру депутата Госдумы, зампреда партии "Яблоко" Владимира Лукина на пост уполномоченного по правам человека в России. Через два дня он был утвержден в должности нижней палатой парламента.
20 мая 2004 года Федеральную антимонопольную службу возглавил Игорь Артемьев, бывший до этого депутатом Госдумы и заместителем главы фракции "Яблоко".
9 января 2008 года Владимир Путин назначил постпредом России при НАТО председателя Конгресса русских общин Дмитрия Рогозина. С 2003 года господин Рогозин был лидером партии "Родина" и ее фракции в Госдуме и имел репутацию прокремлевского политика, пока в 2005 году не объявил об отказе быть "спецназом президента" и переходе в жесткую оппозицию. 23 декабря 2011 года он назначен вице-премьером РФ, курирующим военно-промышленный комплекс.