Родился 13 мая 1964 года в поселке Пушкинские Горы Псковской области. В 1985 году окончил Краснодарское высшее военное училище им. С. М. Штеменко (готовит специалистов в области связи и информационной безопасности), в 2002 году — Российскую академию госслужбы. С 1985 года служил в армии. В 1990 году уволился из вооруженных сил и перешел на работу в органы внутренних дел Москвы. Работал в отделе по борьбе с хищениями социалистической собственности райисполкома Москвы, затем в службе криминальной милиции ГУВД Москвы. В апреле 1999 года возглавил созданный отдел по борьбе с преступлениями в сфере интеллектуальной собственности при главном управлении МВД по борьбе с экономическими преступлениями. В августе 2000 года был назначен начальником линейного УВД аэропорта Шереметьево.
23 сентября 2002 года стал начальником главного управления вневедомственной охраны МВД России. Одним из самых громких его решений было создание межрегионального координационного центра по охране перевозимого имущества, отобравшего контроль за этим видом охраны (в том числе автомобилей крупных бизнесменов) у московских подразделений вневедомственной охраны. 9 декабря 2004 года после преобразования управления в департамент государственной защиты имущества Михаил Суходольский назначен и. о. начальника департамента.
В феврале 2005 года назначен заместителем министра внутренних дел по контролю за милицией общественной безопасности. Курировал департаменты обеспечения безопасности дорожного движения, правопорядка на транспорте, охраны общественного порядка. В 2007-2008 годах отвечал за охрану избирательных участков в ходе федеральных выборов. В марте 2008 года повышен до первого заместителя главы МВД. 31 октября 2008 года сын господина Суходольского пострадал в драке с кавказцами в кафе на территории МГУ. Первый заместитель министра лично прибыл на место и руководил задержанием его обидчиков. 11 июня 2011 года назначен руководителем главного управления МВД России по Санкт-Петербургу и Ленинградской области вместо Владислава Пиотровского, не прошедшего переаттестацию. Уровень преступности в Санкт-Петербурге и Ленинградской области при нем снизился на 9,3% (с 92,7 тыс. правонарушений в 2010 году до 84 тыс.— в 2011-м).
Генерал-полковник полиции. Награжден орденом Почета, медалью ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени (1997). Женат, двое детей.