С 1994 по 2011 год с самолетами ATR-72 произошло 13 авиационных происшествий, в том числе 6 катастроф, в которых погибли 139 человек.
31 октября 1994 года у городка Розлон (штат Индиана, США) при снижении разбился самолет ATR-72-212 компании American Eagle. Погибли все 48 человек на борту. Причиной катастрофы стала потеря управления вследствие обледенения.
8 декабря 1994 года при посадке в аэропорту города Оем в Габоне выехал за пределы полосы борт компании Air Gabon. Из 21 человека на борту никто не погиб.
30 января 1995 года при подлете к Тайбэю (Тайвань) врезался в холм ATR-72-202 компании Transasia Airways. Погибли четыре члена экипажа (пассажиров на борту не было).
21 декабря 2002 года упал в море в районе островов Пэнху еще один грузовой борт тайваньской Transasia Airways. Погибли два члена экипажа.
9 мая 2004 года во время жесткой посадки в аэропорту Пуэрто-Рико получил серьезные повреждения ATR-72-212 компании American Eagle. Никто не пострадал.
6 августа 2005 года в 26 км от Палермо (Сицилия) аварийно сел на воду ATR-72-202 компании Tuninter, летевший из Италии на Тунис. Его топливомер показывал неверные данные и горючее закончилось в полете. Погибли 16 из 39 находившихся на борту.
11 марта 2006 года совершил жесткую посадку в аэропорту Бангалора (Индия) самолет компании Air Deccan с 40 пассажирами. Жертв не было, борт разобран на запчасти.
1 июля 2007 года при посадке в индийском Индауре в плохих погодных условиях выехал за пределы ВПП ATR-72-212A компании Jet Airways с 49 пассажирами. Жертв нет.
19 февраля 2008 года при взлете в аэропорту Путао (Мьянма) потерпел катастрофу ATR-72-212 компании Air Bagan. Самолет был вынужден прервать взлет из-за проблем с двигателем, выкатился за пределы ВПП и разломился. Из 57 человек на борту никто не погиб.
4 августа 2009 года при посадке на острове Самуи (Таиланд) выкатился с ВПП и врезался в диспетчерскую башню самолет компании Bangkok Airways. Погиб один член экипажа.
10 ноября 2009 года при посадке в аэропорту Мумбаи (Индия) выкатился за пределы полосы ATR-72-212A авиакомпании Kingfisher Airlines. 42 человека на борту не пострадали, самолет списан.
4 ноября 2010 года на Кубе при полете в сложных метеоусловиях потерял высоту и разбился в горах самолет Aerocaribbean, совершавший домашний рейс. Погибли все 68 пассажиров и членов экипажа. Причиной катастрофы стало обледенение и ошибки экипажа.
14 июля 2011 года в аэропорту Варшавы столкнулся с тягачем багажных тележек ATR 72-202 авиакомпании Eurolot. Жертв нет, самолет списан из-за повреждений.