Прокуратура Башкирии выявила противоречия федеральному законодательству в ряде республиканских целевых программ. Например, долгосрочная целевая программа «Развитие и поддержка малого и среднего предпринимательства» на 2012–2018 годы», как говорится на сайте прокуратуры, «предполагает предоставление сведений из Росреестра, налоговых органов, органов социального страхования, занятости населения» для получения финансовой помощи. При этом, отмечает ведомство, требовать документы, находящиеся в распоряжении госорганов, «согласно федеральному законодательству, запрещено». Кроме того, «программа содержит дополнительные, не предусмотренные федеральным законом основания для отказа в оказании финансовой поддержки». Также прокуратура усмотрела в программе «возможность отказа в предоставлении финансовой поддержки по усмотрению уполномоченного органа по коррупциогенной формуле „вправе”». В каких именно случаях, ведомство не конкретизирует. На незаконные положения программы прокуратурой республики внесен протест в правительство Башкирии, который находится в стадии рассмотрения.