6 марта 1998 года в Екатеринбурге был зарегистрирован фонд "Город без наркотиков". Евгений Ройзман вошел в состав его учредителей в декабре 1999 года. В 2002 году он также стал советником администрации свердловского губернатора Эдуарда Росселя.
В августе--сентябре 2003 года реабилитационные центры фонда трижды штурмовали бойцы СОБРа в рамках возбужденных по заявлениям экс-реабилитантов уголовных дел. 15 августа в центре в поселке Шарташ милиционерами были избиты президент фонда Евгений Ройзман и вице-президент Андрей Кабанов.
Осенью 2003 года в ходе кампании по выборам в Госдуму баллотировавшегося по одномандатному округу Евгения Ройзмана обвиняли в связях с криминалом. Один из его соперников — экс-глава свердловского УБОПа Василий Руденко называл "Город без наркотиков" организованной преступной группировкой.
В декабре 2005 года суд города Пыть-Яха (ХМАО) осудил директора екатеринбургского центра фонда Максима Курчика и руководителя филиала в Пыть-Яхе Станислава Абазьева на шесть с половиной и шесть лет колонии соответственно в связи со смертью двух реабилитантов.
23 сентября 2007 года съезд "Справедливой России" принял решение не включать в предвыборный список Евгения Ройзмана, возглавлявшего свердловское отделение партии. После этого он написал заявление о выходе из СР.
12 октября 2010 года суд Нижнего Тагила приговорил к трем с половиной годам колонии строгого режима главу местного отделения Егора Бычкова, признав виновным в похищении и незаконном лишении свободы реабилитантов. Затем после вмешательства президента РФ Дмитрия Медведева (ему об этом деле рассказал рок-музыкант Владимир Шахрин) Свердловский облсуд заменил приговор на условный.
Летом 2011 года Евгений Ройзман выступил в защиту жителей свердловского поселка Сагра, подвергшегося нападению вооруженной группировки приезжих, в том числе выходцев с Кавказа. В результате собственного расследования фонда уголовные дела в отношении оборонявшихся жителей Сагры были прекращены. 14 декабря господин Ройзман сообщил, что ФСБ завела на него дело в связи с высказываниями. Областные УФСБ и СКР официально опровергли эту информацию.
22 июля 2011 года Евгений Ройзман объявил о вступлении в партию "Правое дело", которую возглавил бизнесмен Михаил Прохоров. В сентябре господина Прохорова отстранили от руководства партией. Одной из причин СМИ называли нежелание Кремля видеть в федеральном списке "Правого дела" Евгения Ройзмана.
19 июня 2012 года в Екатеринбурге прокуратура провела обыски в реабилитационных центрах фонда в связи со смертью одной из пациенток. Было возбуждено дело по ст. 109 УК (причинение смерти по неосторожности). Позже на основании заявлений бывших реабилитантов завели еще два дела о нанесении побоев и незаконном лишении свободы. Минюст также начал проверку соблюдения фондом законодательства об НКО. 12 октября суд арестовал сотрудника фонда Игоря Шабалина, обвиненного в незаконном лишении свободы семи реабилитанток.