В заключительном 30 туре чемпионата России по футболу 2012/2013 годов «Амкар» на своем поле сыграл 0:0 с «Зенитом», который привез в Пермь полурезервный состав. Это позволило команде занять 11 место и избежать игры в стыковых матчах за право остаться в элитном дивизионе. «Амкар» - по дополнительным показателям клуб опередить нижегородскую «Волгу» и ФК «Ростов». Стоит отметить, что результат, показанный командой – 29 очков в 30 матчах – один из худших в истории выступления «Амкара» в премьер-лиге. По ходу сезона команда пережила смену главного тренера – вместо Николая Трубачева, который номинально занимал эту должность, был назначен Рустем Хузин.