21 февраля 2000 года кандидатом в президенты России был зарегистрирован экс-генпрокурор Юрий Скуратов, находившийся под следствием по обвинению в злоупотреблении полномочиями. Его подозревали в получении 14 костюмов от фирмы "Мабетекс". В марте того же года на выборах Юрий Скуратов получил 0,43% голосов. В 2001 году расследование его дела было прекращено "за недоказанностью".
7 сентября 2005 года экс-глава НК ЮКОС Михаил Ходорковский, ожидавший решения по апелляции на вынесенный приговор, отправил через администрацию СИЗО "Матросская Тишина" в избирком 201-го Университетского округа Москвы уведомление о намерении участвовать в довыборах в Госдуму. 22 сентября. После вступления приговора в силу он потерял право избираться.
20 октября 2005 года избирком 199-го Преображенского округа Москвы зарегистрировал кандидатом в депутаты Госдумы на довыборах находившегося в СИЗО "Матросская тишина" отставного полковника ГРУ Владимира Квачкова. Он обвинялся в покушении на главу РАО "ЕЭС России" Анатолия Чубайса. На выборах Квачков набрал 29% голосов, его опередил отставной полковник ФСБ Сергей Шаврин (36%). В январе 2006 года полковник, оставаясь в СИЗО, заявил о намерении участвовать в довыборах в Госдуму по Медведковскому округу столицы. Однако ему было отказано в регистрации в связи с нарушениями при подаче документов.
22 сентября 2004 года губернатор Камчатки коммунист Михаил Машковцев, против которого расследовалось дело о превышении полномочий, уведомил о намерении участвовать в очередных выборах главы региона. 19 декабря он был переизбран, получив во втором туре 49,58%. В июне 2005 года прокуратура прекратила его дело за истечением срока давности.
9 октября 2003 года действующий губернатор Тверской области Владимир Платов сообщил о желании баллотироваться на третий срок, несмотря на возбуждение против него уголовного дела о превышении полномочий. 7 декабря он проиграл выборы, набрав 12,16% голосов. В ноябре 2005 года он был приговорен к пяти годам тюрьмы, в апреле 2006 года наказание снизили до трех лет условно.