C 5 августа 2009 года в Мосгорсуде рассматривалось дело в отношении экс-сенатора от Башкирии Игоря Изместьева. Он и 12 членов кингисеппской ОПГ обвинялись в бандитизме, терроризме, убийствах, а также покушении на сына президента Башкирии Урала Рахимова. Дело рассматривалось в закрытом режиме, так как его материалы имели гриф "секретно". В декабре 2010 года суд приговорил Изместьева к пожизненному заключению, остальные получили от условного срока до 23 лет.
12 сентября 2011 года в Тверском облсуде начались слушания по существу дела о подрыве поезда "Невский экспресс" в ноябре 2009 года. Процесс закрыли, так как уголовное дело имело ряд материалов с грифом "секретно". В мае 2012 года суд приговорил к пожизненному заключению четырех из десяти обвиняемых, остальные получили от 7 до 15 лет.
12 октября 2011 года в Мосгорсуде присяжные приступили к рассмотрению дела об убийстве 22-летнего болельщика футбольного клуба "Спартак" Юрия Волкова, совершенном в июле 2010 года. Дело закрыли "в связи с заявлениями потерпевших, для обеспечения интересов безопасности участников процесса, родственников и близких лиц". В ноябре суд признал виновными двух уроженцев Чечни, приговорив их к 17 и 6 годам заключения.
23 октября 2012 года в Мосгорсуде начался процесс по делу о подготовке летом 2011 года подрыва скоростного поезда "Сапсан". Дело слушалось в закрытом режиме, поскольку в нем содержались секретные материалы. В декабре суд приговорил четырех обвиняемых к срокам от 15 до 18 лет.
6 июня 2013 года Приволжский районный суд Казани в закрытом режиме начал предварительные слушания дела в отношении экс-сотрудников отдела полиции "Дальний", пытавших задержанного. Было заявлено, что открытое разбирательство "может привести к разглашению сведений, унижающих честь и человеческое достоинство потерпевших, шокировать общественность". Представители потерпевших пытались оспорить это решение, но 19 июля Верховный суд Татарстана отклонил их жалобу.