Эдуард Кочергин родился в 1937 году в Ленинграде. Его родители были репрессированы, а он сам в возрасте трех лет попал сначала в детдом, а позже эвакуирован в Сибирь. В 1960 году после окончания Ленинградского театрального института им. Островского начинает работать в Малом государственном академическом театре оперы и балета. С 1963 по 1966 год работает главным художником Ленинградского театра драмы и комедии (ныне Театр на Литейном), позже в Театре Веры Комиссаржевской. Этапной в творчестве Кочергина стала встреча с режиссером Львом Додиным: в соавторстве ими созданы спектакли "Разбойник" К. Чапека, "Недоросль" Д. Фонвизина, "Живи и помни" по В. Распутину и другие. С 1972 года Кочергин является главным художником Большого драматического театра им. Максима Горького (с 1992 года им. Товстоногова). В 2009 году Кочергин выпускает книгу "Ангелова кукла. Рассказы рисовального человека". В 2011 году выходит книга "Крещенные крестами", в 2013-м — "Записки Планшетной крысы". Все книги автобиографичны.