У союзного государства будут общая территория, границы, гражданство, органы власти, символика. Будет также общая валюта (рубль) с эмиссионным центром в Москве.
Договором предусмотрено, что на первом этапе в союзном государстве создаются:
Высший госсовет — руководящий орган, состоящий из глав государств, глав правительств, руководителей палат парламентов;
парламент — законодательный орган, состоящий из палаты союза и палаты представителей. В палату союза каждое государство делегирует по 36 парламентариев, а палата представителей состоит из 75 депутатов от России и 28 депутатов от Белоруссии, избираемых тайным всеобщим голосованием;
совет министров — правительство союзного государства, куда входят председатель совмина, главы правительств, госсекретарь (зампред), главы МИДов, минэкономики и финансов, руководители основных отраслевых министерств;
суд — арбитражный и контролирующий орган, состоящий из 9 судей, задача которого — обеспечить "единообразное толкование и применение договора";
Счетная палата — своеобразный контрольно-аудиторский орган из 11 человек, призванный осуществлять контроль за финансами союзного государства.
Россия и Белоруссия сохраняют свой национальный суверенитет, остаются полноправными членами международного сообщества и сохраняют членство в международных организациях. Белоруссия сохраняет также свой статус безъядерного государства. В договоре особо отмечается, что "призыв в армию и служба в вооруженных силах стран-участниц осуществляется на основании их конституций, общая армия не создается". Хотя договор обязывает оба государства согласовывать внешнюю политику и политику в области обороны, каждое из них сохраняет свой МИД и минобороны.