В апреле 2016 года с просьбой о передаче Русской православной церкви (РПЦ) Исаакиевского собора обратился к премьер-министру Дмитрию Медведеву митрополит Санкт-Петербургский и Ладожский Варсонофий (Судаков). В конце декабря того же года СМИ сообщили, что правительство Санкт-Петербурга согласилось с этой идеей.
10 января 2017 года пресс-служба губернатора Санкт-Петербурга Георгия Полтавченко сообщила, что вопрос о передаче Исаакиевского собора в пользование РПЦ решен, но здание полностью сохранит музейно-просветительскую функцию. Тема передачи собора вызвала широкий общественный резонанс в Санкт-Петербурге. В январе-феврале в городе прошло несколько митингов как против передачи собора РПЦ, так и в поддержку этого решения.
В начале апреля оппозиционные депутаты заксобрания Санкт-Петербурга поставили вопрос о референдуме по вопросу передачи собора, но 28 июня после многочисленных проволочек депутаты окончательно отклонили эту инициативу. Депутаты через суд требовали признать незаконным бездействие заксобрания при рассмотрении ходатайства о референдуме по «исаакиевскому вопросу», но безуспешно.
15 июня в ходе прямой линии президент РФ Владимир Путин заявил, что вопрос передачи Исаакиевского собора нужно деполитизировать, собор должен сохранить музейную функцию. В этот же день был назначен новый директор Государственного музея-памятника «Исаакиевский собор» Юрий Мудров.
В августе Митрополит Варсонофий подтвердил позицию церкви по Исаакию, но сроков передачи собора не назвал.