В начале 1997 года заместитель министра сельского хозяйства и продовольствия Леонид Холод выступил против квотирования импорта и введения пошлин на ввоз сахара из стран СНГ. При этом, по оценкам Союза сахаропроизводителей, только в результате беспошлинного ввоза сахара через Украину в 1996 году Россия понесла убытки в $200 млн, а введение пошлин в мае 1997-го за май-июнь пополнило российский бюджет на $20 млн.
Весной 1997 года господин Холод оказался в центре скандала с Альфа-банком, обслуживавшим в качестве агента фонд льготного кредитования АПК. Господин Холод публично обвинил Альфа-банк в неудовлетворительном исполнении функций агента и пообещал лишить банк этого статуса. Банк все обвинения отверг.Летом 1997 года имя Леонида Холода зазвучало в связи с конфликтом с Агропромбанком (входившим в "СБС-Агро"). Минсельхозпрод в лице Леонида Холода попытался оспорить очередную эмиссию акций банка, в результате которой заложенный у государства пакет акций АПБ сократился вдвое — до 12,2%. В ответ банк обвинил министерство и лично Холода в лоббировании интересов своих конкурентов. В частности, глава банковской группы "СБС-Агро" Александр Смоленский 11 ноября 1997 году в интервью Ъ назвал господина Холода "вором и жуликом". В результате Агропромбанк не попал в число агентов спецфонда льготного кредитования на 1998 год (в чем его руководители также обвинили Холода). В марте 1998 года Леонид Холод потребовал у банка вернуть выделенные ему на операции по кредитованию АПГ 2,3 трлн руб. и пригрозил судом. В апреле 1998 года стороны все же смогли договориться: трехстороннее соглашение между Минсельхозпродом, "СБС-Агро" и Агропромбанком предусматривало возвращение в фонд лишь части задолженности в размере 1,1 млрд руб. Остальной долг "СБС-Агро" был прощен.
В мае 2000 года имя Леонида Холода вновь зазвучало в связи с его отрицательными откликами на решение правительства об учреждении федерального государственного унитарного предприятия "Росспиртпром". Уже после подписания премьер-министром Михаилом Касьяновым соответствующего постановления господин Холод, в то время начальник сельхоздепартамента аппарата правительства, заявил: "Мы не являемся сторонниками этой идеи. Она противоречит общему направлению отрасли на приватизацию".