19 января 2005 года «Сибнефть» объявила о смене места перерегистрации — из рабочего поселка Любино Омской области в Омск. К этому времени нефтяная компания уже была крупнейшим налогоплательщиком региона. В 2003 году компания перечислила в консолидированный бюджет области 4 млрд руб., в 2004 году — более 13 млрд руб. Перерегистрация в Омске принесла в бюджет города до 300 млн дополнительных доходов.
13 мая 2006 года ОАО «Сибнефть» было переименовано в ОАО «Газпром нефть» и было перерегистрировано из Омска в Санкт-Петербург. Из-за этого регион стал недосчитываться более 14 млрд руб. ежегодно. Согласно программе Минфина РФ о компенсации выпадающих доходов Омской области в 2006–2008 годах, регион должен был получить транши на 13,7 млрд руб.
В 2006 году Омской области выплатили компенсации из федерального бюджета в размере 8,6 млрд руб., однако уже к 2012 году размер дотаций сократился до 3,4 млрд руб. В целом за шесть лет недофинансирование региона превысило 7 млрд руб., а госдолг региона вырос до 22 млрд руб.