С 1997 года — заместитель начальника 7-го производственно-технического предприятия Главного квартирно-эксплуатационного управления Министерства обороны РФ. В 1998 году — начальник управления организационно-технического обеспечения аппарата правительства РФ.
С 1998 по 2000 год — помощник по вопросам госсобственности первых заместителей председателя правительства РФ Юрия Маслюкова и Виктора Христенко. В 2000 году назначен заместителем руководителя секретариата первого заместителя председателя правительства РФ Михаила Касьянова, а затем стал помощником премьера.18 января 2001 года распоряжением правительства был назначен первым заместителем председателя Госкомрыболовства. До назначения Евгения Наздратенко главой комитета в январе-феврале 2001 года господин Моисеев исполнял обязанности председателя Госкомрыболовства.
Женат. Имеет двоих детей.