12 августа 2000 года атомный подводный ракетный крейсер К-141 «Курск» во время учений в Баренцевом море затонул на глубине 108 метров. На борту находились 118 человек, спасти их не удалось. Причиной катастрофы стал взрыв в торпедном аппарате. Спустя 14 месяцев, 8 октября 2001 года, подлодка была поднята на поверхность и отправлена на утилизацию.
16 августа 2002 года сухогруз «Каунас», перевозивший металлопрокат и дизтопливо, столкнулся с опорой Литейного моста на Неве в Санкт-Петербурге и затонул, из-за чего на реке в течение недели была прекращена навигация. Все находившиеся на борту были спасены. Судно разрезали на три части и подняли на поверхность в конце октября того же года. В работах по поднятию «Каунаса» было задействовано два плавкрана и несколько барж. После аварии сухогруз списали.
16 сентября 2005 года на Таймырском полуострове в акватории Дудинского морского порта затонул теплоход «Некрасов». Это произошло в 100–150 м от берега на глубине 8,5 м. В результате катастрофы погибли 14 человек. Уже 21 сентября «Некрасов» вытащили на берег, в операции были задействованы лихтеровоз и четыре буксира. Впоследствии «Некрасов» отремонтировали, и в настоящее время судно находится в эксплуатации.
6 октября 2009 года на Рыбинском водохранилище затонул сухогруз ГТ-18, перевозивший лес, все находившиеся на борту были спасены. 12 ноября сухогруз подняли с помощью плавкрана и двух буксиров и отправили в порт приписки — Нижний Новгород.
10 июля 2011 года в Куйбышевском водохранилище в Татарстане во время сильного шторма на глубине 20 м затонул круизный теплоход «Булгария». Авария была вызвана плохим техническим состоянием, а также перегруженностью судна пассажирами (201 вместо положенных 156). Погибли 122 человека, в том числе 28 детей. 26 июля «Булгария» была поднята со дна Волги и доставлена в сухой док завода им. Куйбышева.