В 2003 году РМК приобрела Кыштымский медеэлектролитный завод (КМЭЗ). Его основной вид деятельности — огневое и электролитическое рафинирование черновой меди, переработка медного лома и отходов, содержащих драгоценные металлы, получение медных катодов марки М00k, медной катанки класса А, а также драгоценных металлов. Мощность производства составляет 140 тыс. т медной катанки в год и 140 тыс. т медных катодов в год.
С 2004 года под управлением РМК находится АО «Карабашмедь». Оно является одним из старейших металлургических предприятий России, история которого насчитывает более 110 лет. В состав предприятия входят медеплавильное производство мощностью до 150 тыс. т черновой меди в год (в том числе 130 тыс. т из минерального сырья). С 2004 по 2018 годы РМК вложила в переоборудование завода более 20 млрд руб.
В 2004 году в структуру РМК вошло АО «Александрийская горно-рудная компания» (АГК, поселок Нагайбакский). Оно специализируется на добыче и первичной переработке медных и медно-цинковых руд. В ее состав входят рудники «Александринский» (производительность составляет 100 тыс. т руды в год), «Чебачий», расположен в Верхнеуральском районе, с 2010 года разрабатывается подземным способом с производительностью 800 тыс. т руды в год и обогатительная фабрика в Нагайбакском районе. В 2018 году началась масштабная модернизация фабрики, направленная на повышение экологической безопасности производства и снижение остаточной влажности отгружаемых концентратов практически в полтора раза. Инвестиции в проект оцениваются более чем в 150 млн руб. Штат АГК насчитывает более 1 тыс. человек.
В 2005 году под управление РМК перешел Маукский рудник в Вишневогорске, история которого началась в 1955 году с открытия Маукского месторождения медно-цинковых руд. Добыча руды подземным способом началась в 2010 году. В настоящее время работы на месторождении временно приостановлены, рудник законсервирован.
В Варненском районе Челябинской области РМК управляет Михеевским горно-обогатительный комбинатом. В 2007 году РМК купила лицензию на разработку месторождения у ирландской компании Celtic Resources Holdings Plc. В 2011 году компания начала строительство на месторождении горно-обогатительного комбината. Он стал крупнейшим проектом по добыче и обогащению медной руды на постсоветском пространстве, который был реализован в рекордно короткие сроки. Михеевское месторождение медно-порфировых руд входит в число 50 крупнейших месторождений мира. Его запасы оцениваются в 629 млн т руды. Мощность переработки руды на Михеевском ГОКе составляет до 27 млн т в год.
Крупнейшим инвестпроектом РМК стал Томинский горно-обогатительный комбинат. Его строят в Сосновском районе Челябинской области на Томинском месторождении медно-порфировых руд. В состав проекта войдут карьеры «Томинский» и «Калиновский» и обогатительная фабрика. Мощность переработки комбината составит 28 млн т руды в год, производительность — до 500 тыс. т медного концентрата в год. Ожидается, что налоговые отчисления комбината в бюджеты различных уровней составят около 120 млрд руб., компания создаст более 1,2 тыс. рабочих мест в регионе. Приоритет при трудоустройстве получат жители Сосновского и Коркинского районов Челябинской области, а также Челябинска.