С 1998 года по 2007 год министерство здравоохранения Свердловской области возглавлял Михаил Скляр. В 2007 году СМИ сообщали, он ушел в отставку из-за того, что имел политические амбиции попасть в Госдуму от «Единой России», но в список включен не был. Кроме того, якобы он вопреки желанию областного правительства допустил на местный рынок медицинского страхования столичные компании.
С сентября 2007 года по 2009 года министерство возглавлял Владимир Климин, бывший глава страховой компании «Мединком». Он был фигурантом расследования о закупках для свердловских больниц томографов, стоимость которых была в несколько раз завышена.
С 2009 года по май 2016 года министерство возглавлял Аркадий Белявский, бывший руководитель окружной клинической больницы ХМАО. Был приглашен на должность губернатором Александром Мишариным (возглавлял регион в 2009–2012 годах). В 2011 году был на грани отставки из-за несвоевременного размещения госзаказов на закупку медицинских препаратов и тест-полосок для определения уровня сахара в крови. По официальной версии, господин Белявский ушел по собственному желанию в связи с выходом на пенсию.
С мая 2016 года по декабрь 2017 года минздравом руководил Игорь Трофимов, бывший глава Росздравнадзора в регионе. В ноябре 2017 года прокуратура внесла ему представление за многочисленные нарушения в работе министерства.