Александр Бортников родился в 1951 году в Перми. В 1973 году окончил Ленинградский институт инженеров железнодорожного транспорта, затем Высшую школу КГБ СССР в Москве. С 1975 года работал в органах госбезопасности. Дослужился до замначальника управления ФСБ по Санкт-Петербургу и Ленинградской области, курировал контрразведывательные операции. С июня 2003 года — начальник УФСБ по Санкт-Петербургу и Ленинградской области. Генерал-майор (звание присвоено в июне 2002 года). Женат, имеет сына.