Александр Григорьев возглавлял УФСБ с момента ухода господина Черкесова в полпредство и до января 2001 года. Сейчас возглавляет Федеральное агентство по госрезервам.
Сергей Смирнов — начальник УФСБ с января 2001 по август 2003 года. 6 августа назначен первым заместителем директора ФСБ России.Александр Бортников — начальник УФСБ (до этого был заместителем начальника управления — курировал контрразведывательные операции) с августа 2003 по март 2004 года. Новая должность — замдиректора ФСБ России. Курирует экономическую контрразведку.