Раф Шакиров родился 6 января 1960 года. В 1982 году окончил истфак МГУ. В 1984-1991 годах работал в Институте мировой экономики и международных отношений АН СССР. С 1990 по 1999 год работал в ИД "Коммерсантъ" на различных должностях: завотделом международной жизни, выпускающим редактором газеты "Коммерсантъ", главным редактором журнала "Деньги", главным редактором газеты "Коммерсантъ". С ноября 1999 года по январь 2000 года занимал должность вице-президента телеканала "ТВ-Центр" по общественно-политическому и информационному вещанию. С февраля по апрель 2000 года — заместитель председателя ВГТРК и гендиректор программы "Вести". С сентября 2001 года — гендиректор и главный редактор издания "Газета". 16 октября 2003 года назначен главным редактором газеты "Известия".