В декабре 2002 года ряды "Единой России" покинул депутат Пермской облдумы Валерий Чупраков. Он пояснил, что "чувствовал себя невостребованным в этой громоздкой политструктуре" и осознал, что его идеи совпадают с программой партии "Яблоко". Позднее господин Чупраков возглавил пермское отделение "Яблока".
В августе 2003 года, назвав партийную деятельность "показухой", ряды "Единой России" покинул член кемеровского регионального политсовета предприниматель Игорь Панин.
В апреле 2004 года из "Единой России" вышел депутат Псковской облдумы Геннадий Подзноев.
В сентябре 2004 года, обвинив партию в том, что она "не имеет реальной политической платформы и не выражает интересов большинства населения", из "Единой России" вышли восемь активистов курского областного отделения партии во главе с членом областного политсовета Владимиром Мамаем.
1 октября 2004 года, обвинив руководство партии в невыполнении предвыборных обещаний и игнорировании интересов избирателей, положил на стол партбилет "Единой России" депутат Госдумы Игорь Морозов.
14 октября 2004 года в знак протеста против поддержки единороссами кандидатуры действующего псковского губернатора Евгения Михайлова на предстоящих выборах главы области из "Единой России" вышел глава администрации Печорского района области Александр Рогов.
17 ноября 2004 года о выходе из партии из-за "диктата, который установился внутри местного отделения", объявили пять депутатов Саратовской облдумы, включая бывшего руководителя фракции единороссов Владимира Титаева.