6 октября 1995 года Генпрокуратура с третьей попытки добилась лишения неприкосновенности основателя пирамиды МММ независимого депутата Сергея Мавроди, в отношении которого было возбуждено уголовное дело в связи с финансовыми махинациями. Вместе с иммунитетом господин Мавроди лишился и депутатского мандата "в связи с нарушением условий осуществления депутатской деятельности". За эти решения проголосовали 303 депутата при необходимом минимуме в 226 голосов. Господин Мавроди долго скрывался за границей и был задержан в Москве лишь 31 января 2003 года. В настоящее время он знакомится с 505 томами своего уголовного дела.
18 сентября 1998 года 226 голосами Госдума лишила иммунитета независимого депутата Надиршаха Хачилаева, удовлетворив первый же запрос Генпрокуратуры. Господин Хачилаев обвинялся в пособничестве чеченским сепаратистам и организации массовых беспорядков в Дагестане в мае 1995 года. В июне 2000 года Верховным судом Дагестана он был приговорен к полутора годам и освобожден по амнистии. 11 августа 2003 года господин Хачилаев был застрелен в Махачкале.
1 ноября 2001 года нижняя палата со второй попытки сняла неприкосновенность с члена фракции СПС Владимира Головлева, обвинявшегося в присвоении крупных денежных сумм в ходе приватизации в Челябинской области, где в середине 90-х он возглавлял комитет по управлению имуществом. За это решение проголосовали 387 депутатов. При этом палата дала согласие лишь на привлечение коллеги к уголовной ответственности, отказав прокуратуре в возможности его ареста. 21 августа 2002 года депутат Головлев был застрелен, когда выгуливал собаку у своего дома в Москве.