Родилась 6 апреля 1980 года в Краснодаре. Училась в языковой спецшколе #36 Краснодара. В 10-м классе ездила по обмену в США. Окончила Кубанский госуниверситет и Школу телевизионного мастерства Владимира Познера.
С февраля 1999 по январь 2000 года — корреспондент телерадиокомпании "Краснодар". С декабря 1999 года освещала боевые действия в Чечне. В январе 2000 года за серию военных репортажей получила премию Союза журналистов Кубани "За профессиональное мужество". Назначена ведущим редактором информационных программ ТРК "Краснодар". В мае 2000 года получила премию II Всероссийского конкурса региональных телерадиокомпаний за репортаж о чеченских детях, отдыхающих в Анапе. В сентябре 2000 года получила президентскую стипендию. В декабре 2000 года заявила в интервью "Комсомольцу Кубани", что "в идеале" хотела бы стать "собкором какого-нибудь западного канала и работать в Москве".
В феврале 2001 года назначена собственным корреспондентом ВГТРК в Ростове-на-Дону. Затем стала спецкором "Вестей", осенью 2002 года вошла в состав президентского пула. В сентябре 2004 года освещала события в Беслане. 9 марта 2005 года получила из рук министра обороны Сергея Иванова медаль "За укрепление боевого содружества". 6 апреля 2005 года во время освещения встречи президента Таджикистана Эмомали Рахмонова с Владимиром Путиным в Сочи Маргарита Симоньян удостоилась личного поздравления с 25-летием и букета от российского президента.
Не замужем.