В Петербурге обыски в банках происходят довольно часто и связаны в основном с расследованием уголовных дел, в которых фигурируют их клиенты. Впрочем, иногда работников банков также подозревают в пособничестве преступникам. Так, осенью 2000 года сотрудники городской прокуратуры, УБЭПа и следственного комитета МВД провели обыски в ПСБ,
Балтонэксимбанке и "Балтийском" в рамках расследования нескольких уголовных дел о коррупции в городской администрации. Банкиров, в частности, подозревали в даче взяток чиновникам в виде заведомо невозвратных кредитов за размещение бюджетных счетов. Впрочем, обвинения никому из банковских работников не предъявлялись. Дважды объектом внимания правоохранительных органов становился и местный филиал Альфа-банка. В июне 2001 года сотрудники РУБОПа задержали менеджера по работе с корпоративными клиентами филиала Елену Рутковскую, которую обвинили в мошенничестве с деньгами клиентов: якобы госпожа Рутковская способствовала переводу средств клиентов банка на счет подставной фирмы по поддельным платежным поручениям. Осенью 2003 года в местный Альфа-банк наведались сотрудники УФСБ, расследовавшие дело группировки, занимавшейся контрабандой и незаконным возмещением НДС. В итоге в марте 2004 года по обвинению в пособничестве преступникам был арестован бывший заместитель управляющего филиалом Сергей Безруких. В настоящее время расследование этого дела закончено, обвиняемые знакомятся с материалами дела.
