6 сентября 1991 года была создана комиссия Верховного совета РСФСР по расследованию причин и обстоятельств путча в СССР. 13 января 1992 года материалы расследования предоставлены для парламентских слушаний и в Генпрокуратуру. В феврале 1994 года для участников путча объявлена амнистия.
6 мая 1993 года Верховный совет РФ начал расследование столкновений в Москве во время демонстрации левой оппозиции 1 мая. 23 июля 1993 года парламент предложил Борису Ельцину уволить мэра Москвы Юрия Лужкова и главу МВД Виктора Ерина. Президент РФ предложение проигнорировал.
13 января 1995 года Госдума создала комиссию по расследованию причин и обстоятельств кризиса в Чечне. В ходе работы в комиссии произошел раскол, поэтому в августе 1995 года ее итоговый отчет, назвавший виновниками войны Бориса Ельцина, министра обороны Павла Грачева и президента СССР Михаила Горбачева, подписали лишь пять из девяти членов.
21 февраля 1997 года Госдумой была создана комиссия Тельмана Гдляна по проверке фактов коррупции должностных лиц Санкт-Петербурга. Комиссия собрала компромат на мэра Анатолия Собчака и еще 10 чиновников — руководителей города. 13 сентября 1998 года Генпрокуратура предъявила мэру обвинение в коррупции, которое было снято в ноябре 1999 года.
19 марта 1997 года Госдума приняла решение проверить факты участия должностных лиц всех уровней в коррупционной деятельности. Результатов расследование не принесло, и 1 декабря 1999 года спецкомиссия распущена.
16 июля 1998 года Госдума начала расследование обстоятельств убийства генерала Льва Рохлина. В январе 2000 года материалы расследования переданы в Генпрокуратуру, их содержание не раскрывалось. В совершении преступления обвиняется супруга погибшего Тамара Рохлина.
15 октября 1998 года Совет федерации создал комиссию по расследованию обстоятельств, приведших к дефолту. 17 марта 1999 года палата на основе выводов комиссии рекомендовала привлечь к ответственности ряд чиновников, многие из которых к тому времени уже лишились своих постов, например, премьер Сергей Кириенко, глава ЦБ Сергей Дубинин.
9 декабря 1998 года создана комиссия Госдумы по убийству депутата Галины Старовойтовой. Никаких видимых результатов депутатское расследование не принесло.
10 сентября 2004 года создана парламентская комиссия по расследованию теракта в Беслане, в которую вошли 11 депутатов от Совета федерации и 10 — от Госдумы. Итоги работы комиссии ожидаются к декабрю 2005 года.