В Уголовном кодексе РФ, вступившем в силу 1 января 1997 года, конфискация перестала применяться к преступлениям средней тяжести (в том числе налоговым преступлениям). 21 ноября 2003 года Госдума вообще отменила статью 52 ("Конфискация имущества"), заменив конфискацию штрафами.
Весной 2006 года в Думу был внесен законопроект "О внесении изменений в отдельные законодательные акты РФ в связи с принятием федерального закона 'О ратификации конвенции Совета Европы о предупреждении терроризма' и федерального закона 'О противодействии терроризму'". Этот документ был принят в третьем чтении 5 июля, одобрен Советом федерации 14 июля и подписан президентом РФ 27 июля. Данный документ вернул практику конфискации имущества. Такая мера стала применяться по 45 статьям Уголовного кодекса — из разделов "Преступления против личности", "Преступления в сфере экономики", "Преступления против общественной безопасности и общественного порядка", "Преступления против государственной власти" и "Преступления против мира и безопасности человечества".