21 августа 1998 года во дворе Центральной мечети Махачкалы взорвана "Волга" муфтия Дагестана Саида Мухаммад-хаджи Абубакарова. Погибли муфтий и его брат.
26 октября 1998 года в Грозном покушались на муфтия Чечни Ахмата Кадырова, взрывом у здания муфтията ранен его водитель. Будучи муфтием до августа 2000 года, господин Кадыров пережил пять покушений. В декабре 1999 года полевые командиры Шамиль Басаев и Хаттаб объявили за его голову награду $100 тыс. 9 мая 2004 года ставший президентом Чечни Ахмат Кадыров убит взрывом бомбы на стадионе в Грозном.
16 июня 2000 года в Урус-Мартане (Чечня) застрелен имам районной мечети Умар Идрисов. Убийство связывали с поддержкой, оказываемой им Ахмату Кадырову.
8 января 2001 года во дворе своего дома расстрелян муфтий Урус-Мартановского района Хасмагомед Умалатов. В убийстве обвинили членов бандгруппы Айнди Ташаева.
2 декабря 2002 года в Грозном похищен и впоследствии расстрелян заместитель муфтия Чечни Рамзан Гичикаев. В июле 2005 года обвиняемый в его убийстве полевой командир Шамсутдин Салаватов приговорен к пожизненному заключению.
31 августа 2003 года во дворе своего дома расстрелян муфтий Веденского района Чечни Шаиман Мадагов. По данным следствия, убийство совершила банда Хусейна Гакаева.
18 июля 2004 года предотвращено покушение на муфтия Чечни Ахмеда Шамаева. Возле его дома в селении Вашиндарой обезврежено самодельное взрывное устройство. Годом ранее боевики застрелили его сына и двух родственников.
14 марта и 9 декабря 2006 года совершены покушения на главу Духовного управления мусульман (ДУМ) Карачаево-Черкесии и Ставрополья Исмаила Бердиева. Его дом был обстрелян из автомата, во двор брошена граната.
25 сентября 2006 года в Кисловодске застрелен заместитель главы ДУМ Карачаево-Черкесии и Ставрополья Абубекир Курджиев. Один из убийц получил 20 лет тюрьмы.
31 января 2007 года в центре Назрани обстрелян автомобиль муфтия Ингушетии Иса-Хаджи Хамхоева. Находившийся за рулем сын муфтия вывез отца из-под обстрела. Оба получили ранения.