Впервые пепси-кола появилась в СССР в 1959 году на Американской национальной торговой выставке в Москве. Первый секретарь ЦК КПСС Никита Хрущев, попробовав американскую газировку и аналогичный напиток, изготовленный в Москве специально для выставки, заявил, что "московская пепси-кола намного лучше, чем та, что сделана в Нью-Йорке", после чего стал предлагать газировку окружающим со словами: "Вот хорошая пепси-кола".
В 1972 году президент PepsiCo Дональд Кендалл и председатель Совмина СССР Алексей Косыгин подписали договор о строительстве в СССР десяти заводов по розливу пепси и поставке концентрата напитка. За это СССР предоставил компании монополию на импорт и продажу водки "Столичная" в США. В 1974 году в Новороссийске открылся первый завод по розливу пепси. Газировка продавалась в рознице по цене 45 коп. за бутылку 0,33 л. В 1986 году PepsiCo как спонсор Игр доброй воли в Москве стала первой в истории СССР западной фирмой, разместившей рекламу на советском телевидении.
В 90-х годах прошлого века компания открыла заводы в Сочи, Самаре, Екатеринбурге и Санкт-Петербурге и начала выпуск соков, воды и других безалкогольных напитков. В 2002 году в подмосковной Кашире PepsiCo запустила завод по производству чипсов Lays. В марте 2007 года компания начала строить завод напитков в подмосковном Домодедове мощностью 2 млрд л в год.
Сегодня PepsiCo занимает около 20% российского рынка газированной воды и 30% рынка чипсов. Основные брэнды — в сегменте напитков — Pepsi, Mirinda, 7Up, минеральной воды — Aqua Minerale, чипсов — Lays и Lays Max, Cheetos, сухарики "Хрустим". Выручка в России в 2006 году составила $850 млн, общий объем инвестиций в Россию с 1991 года — $850 млн.