СПБРР создан в 1994 году с участием мэрии, которой принадлежало 20%.В результате эмиссий доля мэрии размылась до 1,31%. АВК стала акционером СПБРР в 2001 году, купив 6% банка, а в 2003 году получила контроль. Участники рынка считают, что компанию АВК контролировал ее основатель — Игорь Костиков. Он возглавлял компанию до 1999 года, пока не стал зампредом комитета финансов Петербурга, а с 2000-го по 2004 год господин Костиков возглавлял ФКЦБ. Ранее он неоднократно заявлял, что не имеет никакого отношения к АВК и банку, поскольку избавился от всех финансовых активов при переходе на работу в петербургскую администрацию.
В начале апреля 2007 года ЦБ РФ отозвал лицензию у СПБРР, объяснив это нарушением требований, предусмотренных статьей 7 федерального закона "О противодействии легализации (отмыванию) доходов, полученных преступным путем, и финансированию терроризма". Банк входил в систему страхования вкладов, поэтому Агентство страхования вкладов (АСВ) объявило конкурс на выбор банка, который будет производить выплаты физлицам — вкладчикам СПБРР. Конкурс выиграл Связь-банк. Сейчас, по словам вице-президента Связь-банка Елены Троицкой, выплаты по страховому возмещению вкладчикам составляют 95%. В связи с решением Арбитражного суда Санкт-Петербурга и Ленобласти от 3 июля 2007 года о признании банкротом Санкт-Петербургского банка реконструкции и развития и назначением конкурсного управляющего ЦБ РФ принял решение прекратить с 13 июля 2007 года деятельность временной администрации по управлению СПБРР. Конкурсным управляющим банка назначено Агентство по страхованию вкладов (АСВ).