17 апреля 2002 года милиция обыскала офис администрации Ненецкого автономного округа и изъяла документы, связанные с рабочим графиком главы округа Владимира Бутова, обвиненного в неисполнении решения суда. В декабре дело закрыли по "реабилитирующим обстоятельствам".
4 сентября 2003 года сотрудники Генпрокуратуры обыскали кабинет и квартиру тверского губернатора Владимира Платова. Следствие подозревало, что он незаконно передал фирме "Ортодокс+" облигации на 500 млн руб. 11 ноября 2005 года уже бывший губернатор получил пять лет тюрьмы.
13 мая 2004 года произведена выемка документов в кабинете саратовского губернатора Дмитрия Аяцкова. Следователи расследовали растрату 70 млн руб. при закупке в 1998 году американских комбайнов. Днем позже ему предъявили обвинения, которые были сняты 7 июля.
В декабре 2004 года прошли обыски в самарской обладминистрации. 27 декабря губернатор Константин Титов слег в больницу с гипертонией, а уже через день его обвинили в незаконном выделении из бюджета кредита ОАО "Самарский губернский торговый дом". 24 февраля 2005 года господина Титова переквалифицировали в свидетеля.
В ночь на 16 июля 2005 года обыску подверглись кабинет и квартира главы Ивановской области Владимира Тихонова. Ему вменяли в вину получение взятки от дорожно-строительной фирмы. После обыска добавились обвинения в незаконном хранении боеприпасов. 20 декабря губернатор добровольно сложил полномочия, а 4 сентября 2006 года дела были прекращены за отсутствием состава преступления.
19 мая 2006 года Генпрокуратура произвела обыск кабинета и квартиры губернатора НАО Алексея Баринова в рамках дела о хищении из ОАО "Архангельскгеолдобыча" 30 млн руб. 21 июля он отстранен от должности и 6 сентября 2007 года осужден на три года условно.
18 апреля 2007 года рабочий кабинет амурского губернатора Леонида Короткова посетили работники Генпрокуратуры. Результатом проверки стало возбуждение четырех уголовных дел, в том числе о незаконном финансировании ФК "Амур". 10 мая он отстранен от должности и сейчас находится под подпиской о невыезде.