Юрий Балуевский родился 9 января 1947 года в городе Трускавец Львовской области Украины. После окончания в 1970 году Ленинградского высшего общевойскового командного училища успел покомандовать взводом и ротой, после чего служил исключительно как штабной офицер. Так, в начале 90-х он был офицером для особых поручений у замминистра обороны СССР Владислава Ачалова, смещенного за поддержку ГКЧП.
В августе 1997 года господин Балуевский возглавил Главное оперативное управление Генштаба. Одним из первых его решений стала отмена регулярных докладов для СМИ о потерях российских войск в Чечне. В начале 2000-х годов на посту замначальника Генштаба участвовал в подготовке Договора о сокращении стратегических наступательных потенциалов.
19 июля 2004 года господин Балуевский был назначен начальником Генштаба. В декабре 2005 года стало известно, что он предложил заменить военные округа, главные командования видов вооруженных сил и командования родов войск региональными командованиями. 19 мая 2006 года реформа была одобрена.
3 апреля 2006 года выступил против института полковых священников. По его мнению, "ставку делать надо на повышение уровня подготовленности сержантов и командиров взводов".
В течение 2007 и 2008 годов неоднократно высказывался против размещения в Европе системы ПРО США. В ответ на действия Вашингтона он грозил принятием "адекватных мер" и выходом из договора о ликвидации ракет средней и меньшей дальности.
19 января 2008 года на научной конференции Академии военных наук заявил о готовности России "превентивно" применять ядерное оружие, что расходится с действующей военной доктриной, предусматривающей использование ядерного оружия только "в ответ на крупномасштабную агрессию".
На той же конференции господин Балуевский высказался против идеи министра обороны Анатолия Сердюкова о переводе главного штаба ВМФ в Санкт-Петербург. По информации СМИ, это вызвало конфликт в ведомстве, после чего глава Генштаба даже подал рапорт об отставке.
В апреле 2008 года выступил с предложением по передаче Российской оборонной спортивно-технической организации (РОСТО) под прямой контроль Минобороны. Резко против инициативы высказалось руководство РОСТО, обвинившее военное ведомство во вмешательстве в дела общественной организации.