В ноябре 1993 года Республиканская и Социал-демократическая партии и Российский христианско-демократический союз для участия в парламентских выборах создали избирательный блок "Явлинский--Болдырев--Лукин" ("Яблоко"). В декабре блок набрал 7,86% голосов (шестое место) и получил 27 депутатских мандатов. В 1994 году блок покинула часть Республиканской партии во главе с Владимиром Лысенко.
В январе 1995 года "Яблоко" преобразовано в общественное объединение. Григорий Явлинский стал его председателем, господа Болдырев и Лукин — вице-председателями. Уже в сентябре Юрий Болдырев покинул "Яблоко", заявив о несогласии с разработанным партией законопроектом "О разделе продукции". 17 декабря 1995 года на думских выборах "Яблоко" получило 6,89% (четвертое место) и 45 депутатских мандатов. В июне 1996 года Григорий Явлинский принял участие в президентских выборах, набрав 7,34% голосов (четвертое место).
В конце 1990-х годов в результате внутренней борьбы в "Яблоке" победила идея господина Явлинского о создании организации с жесткой партийной структурой, было ликвидировано коллективное членство, а членам "Яблока" запретили участвовать в других движениях. В результате "Яблоко" со скандалами покинули Иван Грачев и Вячеслав Игрунов. Последний заявил, что "Яблоко" превратилось в "команду обслуживания несостоявшихся амбиций одного человека". В декабре 1999 года на думских выборах объединение набрало 5,93% (шестое место), депутатами стали 20 человек. В марте 2000 года господин Явлинский повторил попытку стать президентом, но получил 5,8% голосов (третье место).
В декабре 2001 года объединение преобразовано в партию, господин Явлинский избран ее председателем.
В декабре 2003 года на выборах в Госдуму партия набрала 4,3% голосов и не прошла в парламент, четыре ее члена избрались в округах. В феврале 2004 года руководство партии покинул Владимир Лукин, назначенный Госдумой уполномоченным по правам человека.
С 2004 года лидеры "Яблока" предлагали свою партию в качестве площадки для создания широкой коалиции. Однако реально к "Яблоку" в апреле 2006 года присоединилась только "Зеленая Россия" Алексея Яблокова. В июне 2006 года "Яблоко" окончательно отказалось от объединения с другими демократами, назвав это "фантастикой". В декабре 2007 года партия вновь не попала в Госдуму, набрав только 1,59% голосов.